To Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Μ.Σ.) «Βυζαντινός Κόσμος: Ιστορία και Αρχαιολογία» του Τμήματος Ιστορίας και Αρχαιολογίας ιδρύθηκε το 2018 (ΦΕΚ 1729/Β΄/18-5-2018), μετά τη διαίρεση σε τρεις κατευθύνσεις του παλαιού, ενιαίου μεταπτυχιακού προγράμματος του Τμήματος, το οποίο λειτουργούσε από το ακαδημαϊκό έτος 1989-1990.
Σκοπός του Π.Μ.Σ. «Βυζαντινός Κόσμος: Ιστορία και Αρχαιολογία» είναι η παροχή υψηλού επιπέδου μεταπτυχιακής εκπαίδευσης στα επιστημονικά πεδία της Βυζαντινής Ιστορίας και της Βυζαντινής και Μεταβυζαντινής Αρχαιολογίας και Τέχνης. Η φοίτηση είναι διετής και η επιτυχής ολοκλήρωση των σπουδών οδηγεί στην απονομή Διπλώματος Μεταπτυχιακών Σπουδών «Βυζαντινός Κόσμος: Ιστορία και Αρχαιολογία/The Byzantine World: History and Archaeology», στις εξής ειδικεύσεις:
1. Βυζαντινή Ιστορία / Byzantine History
2. Βυζαντινή Αρχαιολογία και Τέχνη / Byzantine Art and Archaeology
Οι απόφοιτοι του Προγράμματος αποκτούν εξειδικευμένες γνώσεις και κατάρτιση στα επιστημονικά πεδία της Βυζαντινής Ιστορίας και της Βυζαντινής και Μεταβυζαντινής Αρχαιολογίας και Τέχνης, τόσο σε θεωρητικό επίπεδο όσο και σε επίπεδο μεθοδολογικών εργαλείων και πρακτικής εμπειρίας. Με βάση τα προσόντα αυτά, μπορούν να παράγουν υψηλής ποιότητας επιστημονικό έργο, να συνεχίσουν τις σπουδές τους σε επίπεδο διδακτορικού και να σταδιοδρομήσουν στον ακαδημαϊκό χώρο, στην έρευνα και στην Αρχαιολογική Υπηρεσία του ελληνικού κράτους.